歐巴馬總統上台後，公開放棄小布希「全球反恐戰爭」的說法，代之以「海外緊急應變行動」一詞，試圖消除美國與伊斯蘭國家的對立。歐巴馬的反恐重心轉移到阿富汗與巴基斯坦境內，集中對付基地組織及塔里班。歐巴馬下令關閉關達納摩監獄，揭露小布希多項反恐的權宜性措施，決定停止濫權的審問，禁止偵訊使用酷刑；但是，國會通過的《國防授權法》卻阻止總統將監禁者移出該監獄到美國本土或其他國家。五月一日，七十九名美國海豹突擊隊搭乘四架直昇機，鎖定目標擊斃賓拉登，使九一一事件後追尋賓拉登的行動告一個段落，美國的反恐行動也進入另一個起點。
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