在執政百日民調不理想的社會壓力下，蔡英文新政府正悄悄地對於科技預算分配做一大規模而且極端粗糙的調整。在九月初倉促地決定了統刪收回各部會百分之十的科技預算總共新台幣一百億之後，要求包括科技部、經濟部等各相關單位，在短短的兩、三個星期內，針對蔡英文政府的「五大創新產業」提出相應計畫作為這些預算重新分配的基礎。作為一個政府新政策的推動工具，這類導引式的預算分配原則本來無可厚非，但是不分青紅皂白的統刪手法以及徵求內部計畫過程的倉促與非專業，不僅無法達到其創新產業目標，也將對於長期進行「基礎研究」的研發體制造成結構性的崩壞。相對於韓國經濟產業部會類似的創新產業研發計畫，歷經一到兩年的產業生態專業調查與國際技術諮詢，才凝聚了具體的核心發展目標，新政府的作法，不得不讓人回想其上次民進黨執政時「兩兆雙星」以及「矽島計畫」對於國內產業發展與科研人力資源的扭曲，間接埋下了後來「四大慘業」（DRAM、面板、太陽能、LED）無力升級一蹶不起的伏筆。

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